6-姜烯酚与NF-κB分子对接蛋白构象分析研究

王婧超；徐翠翠；蔡绍曦

关键词：6-姜烯酚, NF-κB, 分子对接

摘要：目的：：通过对6-姜烯酚(6-SH)与NF-κB分子间的作用方式,评价6-SH对NF-κB信号通路的影响。方法：利用蛋白质组学方法及分子对接技术,使用western-blotting和Discoveray Studio 2.5分子建模和模拟环境软件,采用模拟蒙特卡罗方法在LigandFit模块中将6-姜烯酚与NF-κB分子的活性位点进行柔性对接,观察配体结合取向、结合构象以及形状匹配等多种表现。结果：6-SH能够抑制NF-κB蛋白的表达；6-SH与NF-κB的Tyr57,Val58,Cys59,Tyr143,Lys145,Lys146氨基酸残基末端结合,并且与Lys145之间产生交互作用,终一致性分析得分为41.27,配体内部的能量为-3.52。结论：6-SH通过与NF-κB活性位点结合,影响其调控的信号转导通路。